Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SNX18P9-201ENST00000440580 835 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 APOPT1-206ENST00000476323 757 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC092045.1-201ENST00000495716 1231 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 OR7E1P-201ENST00000533891 958 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 DNM1P47-201ENST00000560757 334 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 SPATA8-AS1-202ENST00000560888 392 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC105243.1-202ENST00000583942 847 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC105227.1-201ENST00000586227 438 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC022167.5-202ENST00000637237 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 PPP1R11-206ENST00000376773 1640 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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VAMP3Q15836 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MIR345-201ENST00000362114 98 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MIR128-2-201ENST00000384893 84 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL117344.1-201ENST00000407196 616 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 MEG8-201ENST00000414488 800 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
VAMP3Q15836 AC114402.2-201ENST00000432760 643 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
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