Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 C20orf194-201ENST00000252032 6869 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 PLXNA2-201ENST00000367033 11444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ARHGEF11-202ENST00000368194 6889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 WDR36-203ENST00000506538 7048 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 KCNB1-201ENST00000371741 11879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 BDNF-203ENST00000395978 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TTTY15-202ENST00000440408 5284 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 SCAPER-202ENST00000324767 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 THBS1-201ENST00000260356 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TACC2-212ENST00000453444 9158 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TFDP2-215ENST00000489671 9857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ZMYND8-206ENST00000372023 5144 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 UVSSA-202ENST00000389851 12605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC012560.1-203ENST00000510550 595 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 KIAA0040-202ENST00000444639 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 OR4K13-203ENST00000641904 5684 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MMACHC-201ENST00000401061 5296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 TOR1AIP2-203ENST00000482587 7067 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 SCN5A-204ENST00000414099 8303 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 PCNX1-201ENST00000304743 12919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 KIRREL1-203ENST00000368172 6870 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ACACB-203ENST00000377854 6588 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RYR3Q15413 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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