Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CLNS1AP1-201ENST00000435954 682 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC022784.4-201ENST00000518589 422 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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BRD3Q15059 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL590004.3-202ENST00000445883 451 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 TIMM8BP2-201ENST00000445940 251 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AC090502.3-201ENST00000552046 529 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
BRD3Q15059 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
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