| BRD3 | Q15059 | PHLDB2-214 | ENST00000495180 | 4159 nt | TSL 2 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| BRD3 | Q15059 | HEMGN-202 | ENST00000616898 | 2305 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.43 | | |
| BRD3 | Q15059 | AJ009632.2-202 | ENST00000634644 | 1513 nt | TSL 5 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | RANBP3L-202 | ENST00000502994 | 2278 nt | APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | TMEM161BP1-201 | ENST00000457388 | 1457 nt | BASIC | 6.09 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | LIMA1-215 | ENST00000552823 | 3254 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | KCNC4-201 | ENST00000369787 | 18750 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP005212.5-201 | ENST00000577614 | 3505 nt | TSL 5 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | SUPT3H-203 | ENST00000371460 | 2389 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | ELF1-204 | ENST00000625359 | 2032 nt | TSL 2 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | SLCO1B7-201 | ENST00000421593 | 1923 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL353751.1-201 | ENST00000354541 | 495 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | RNU6-468P-201 | ENST00000384003 | 109 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | GCNT1P4-201 | ENST00000404096 | 329 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC020719.1-201 | ENST00000448977 | 518 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC104164.1-201 | ENST00000460282 | 590 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| BRD3 | Q15059 | LINC00613-201 | ENST00000504365 | 467 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC022784.4-201 | ENST00000518589 | 422 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC083923.2-201 | ENST00000519880 | 574 nt | TSL 4 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC084125.1-201 | ENST00000525461 | 429 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC019227.1-201 | ENST00000526902 | 510 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000593.3-201 | ENST00000546065 | 578 nt | TSL 2 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC078820.1-201 | ENST00000548702 | 742 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC009396.1-201 | ENST00000553628 | 1079 nt | TSL 2 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC091544.7-201 | ENST00000554000 | 240 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL359238.1-201 | ENST00000557770 | 744 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR1E3-201 | ENST00000575608 | 948 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR4502-201 | ENST00000580432 | 81 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL157392.3-211 | ENST00000599378 | 509 nt | TSL 4 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | PSMA6P4-201 | ENST00000603247 | 718 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL137072.1-201 | ENST00000603444 | 466 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL161457.2-204 | ENST00000609241 | 869 nt | TSL 5 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | uc_338.31-201 | ENST00000615595 | 186 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | FRG1HP-204 | ENST00000617940 | 757 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | U6.48-201 | ENST00000618523 | 106 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | OR51F1-202 | ENST00000624103 | 939 nt | APPRIS ALT1 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC111152.1-202 | ENST00000635848 | 339 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | PWAR1-201 | ENST00000624188 | 2414 nt | BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | LRRC8B-201 | ENST00000330947 | 7593 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00320-204 | ENST00000437238 | 2004 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | CCDC158-202 | ENST00000434846 | 1728 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC025034.1-201 | ENST00000552778 | 1711 nt | TSL 3 BASIC | 6.08 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | LIMA1-203 | ENST00000547825 | 3920 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | PRTG-201 | ENST00000389286 | 11967 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | STON1-201 | ENST00000404752 | 5511 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | EIF1AY-201 | ENST00000361365 | 1390 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL365214.2-201 | ENST00000433684 | 1365 nt | TSL 2 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | GRAMD2B-202 | ENST00000502348 | 1363 nt | TSL 2 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL137100.1-201 | ENST00000556703 | 1620 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | CTSV-203 | ENST00000538255 | 4322 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | ESRRG-204 | ENST00000361525 | 5363 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | PSG1-202 | ENST00000312439 | 1882 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC107027.3-201 | ENST00000565095 | 3473 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | MYO9A-203 | ENST00000444904 | 7749 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | SMG1-201 | ENST00000330588 | 1588 nt | TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC245100.4-204 | ENST00000635587 | 1555 nt | TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073136.1-201 | ENST00000449426 | 2884 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | SDCBP-213 | ENST00000630925 | 2076 nt | TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP000756.2-201 | ENST00000624168 | 2567 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | NDUFA5-207 | ENST00000471770 | 5608 nt | TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | S100G-201 | ENST00000380200 | 455 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | NCSTNP1-201 | ENST00000406229 | 144 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL139805.1-201 | ENST00000407837 | 289 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | MIR1275-201 | ENST00000408770 | 80 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | Z68694.1-201 | ENST00000413929 | 841 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL592078.1-201 | ENST00000421866 | 321 nt | TSL 3 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL162430.2-201 | ENST00000422306 | 435 nt | TSL 3 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC073310.1-201 | ENST00000423226 | 1033 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC00400-201 | ENST00000425609 | 547 nt | TSL 3 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC099782.1-201 | ENST00000425889 | 474 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC092013.1-201 | ENST00000438795 | 332 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL590004.3-202 | ENST00000445883 | 451 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | TIMM8BP2-201 | ENST00000445940 | 251 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AL358075.1-201 | ENST00000450004 | 649 nt | TSL 3 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | LRRC77P-202 | ENST00000463642 | 457 nt | TSL 4 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| BRD3 | Q15059 | RN7SL362P-201 | ENST00000494228 | 267 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
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| BRD3 | Q15059 | AC137627.1-201 | ENST00000545761 | 289 nt | BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AC090502.3-201 | ENST00000552046 | 529 nt | TSL 3 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | LINC01900-202 | ENST00000584898 | 603 nt | TSL 5 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |
| BRD3 | Q15059 | AP001120.2-201 | ENST00000589395 | 296 nt | TSL 3 BASIC | 6.07 | □□□□□ -1.44 | | |