Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 C10orf120-201ENST00000329446 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL139275.1-201ENST00000447315 824 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC020551.1-201ENST00000512036 539 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 AC124854.1-201ENST00000512210 511 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms