Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC012254.5-201ENST00000623573 478 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC034229.6-201ENST00000623704 224 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SSPNQ14714 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HBS1L-206ENST00000415177 2636 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CEP44-206ENST00000503780 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PSG6-204ENST00000402603 1412 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 C11orf54-202ENST00000354421 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LRRC69-202ENST00000448384 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 H3F3AP3-201ENST00000497682 407 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC007495.1-203ENST00000569025 888 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 LINC01440-210ENST00000629744 541 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 FRYL-202ENST00000358350 11706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 AL512310.3-201ENST00000547023 1335 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SSPNQ14714 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms