Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 KARSP3-201ENST00000571212 1504 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 TCF7L2-217ENST00000536810 3953 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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COL4A6Q14031 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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COL4A6Q14031 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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COL4A6Q14031 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 TSC1-201ENST00000298552 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AMOT-203ENST00000371959 7319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC016229.2-201ENST00000591331 417 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
COL4A6Q14031 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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