Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SORT1-209ENST00000538502 6993 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ZNF585A-201ENST00000292841 8618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC00314-201ENST00000324988 607 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 IFNG-AS1-202ENST00000538665 1791 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RPS17P2-201ENST00000461663 408 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
CACNA1SQ13698 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
CACNA1SQ13698 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
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