Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SOX9-AS1-208ENST00000529667 340 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF137P-202ENST00000597158 308 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC01138-208ENST00000639159 1521 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 NRP1-205ENST00000374823 3737 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KLHL5-201ENST00000261425 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DPYD-202ENST00000370192 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RPS29-201ENST00000245458 296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNA5SP65-201ENST00000363166 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SDHC-203ENST00000392169 369 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TRBV29OR9-2-201ENST00000427589 333 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL445623.1-201ENST00000440888 237 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
FOXE3Q13461 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
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