Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC119044.1-202ENST00000548463 339 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPN13Q12923 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HSPE1-MOB4-201ENST00000604458 890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 KIF27-202ENST00000334204 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC092130.1-201ENST00000565531 531 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC109361.2-202ENST00000512514 483 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPN13Q12923 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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