Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AURKA-208ENST00000395915 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC090220.1-201ENST00000593078 1699 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 IKZF3-217ENST00000623724 9787 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TMCC1-203ENST00000432054 5631 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LRRFIP2-201ENST00000336686 3208 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 A2M-201ENST00000318602 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 METTL14-201ENST00000388822 6669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ZC3H13-202ENST00000282007 6412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 SLC7A2-202ENST00000398090 7557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 RAB9AP4-201ENST00000415230 609 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
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CENPFP49454 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 DNM1L-203ENST00000381000 4397 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 ZCCHC2-204ENST00000586834 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 BCLAF3-203ENST00000379687 6528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
CENPFP49454 FSD2-201ENST00000334574 6418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
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