Protein–RNA interactions for Protein: P23471

PTPRZ1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1P23471 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PTPRZ1P23471 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RARB-204ENST00000458646 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 MAPK10-344ENST00000641718 3746 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRZ1P23471 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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