Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL606534.4-201ENST00000427176 792 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 IGKV1OR10-1-201ENST00000442306 329 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC016908.1-201ENST00000442571 1219 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR52I1-201ENST00000450052 1050 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC104849.1-201ENST00000462623 405 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MYL2-203ENST00000548438 664 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 STARD13-AS-232ENST00000609137 882 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC00652-201ENST00000412553 3299 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SENP8-201ENST00000340912 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 DTHD1-206ENST00000639862 3819 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SYNPO2-203ENST00000434046 3588 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC122713.2-201ENST00000624942 3335 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 SEPHS1P4-201ENST00000446112 1176 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
HOXD8P13378 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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