Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 NAV2-AS5-201ENST00000528726 3307 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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LRRTM2O43300 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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LRRTM2O43300 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC124856.1-201ENST00000600819 896 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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LRRTM2O43300 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
LRRTM2O43300 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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