Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 AC023813.1-201ENST00000565055 306 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 BX322650.1-201ENST00000332359 2143 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ANGEL2-201ENST00000360506 4323 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 EEF1A1P9-201ENST00000514975 1383 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 OR8B8-202ENST00000642064 3914 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 HNRNPR-210ENST00000478691 7646 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 GAS1RR-201ENST00000415801 4387 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SLC25A12-202ENST00000422440 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL139805.2-201ENST00000455305 2433 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ATG4AP1-201ENST00000416893 538 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC018450.1-202ENST00000465880 529 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC011352.2-201ENST00000514574 1016 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CTNNA3-205ENST00000545309 555 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CNTNAP3P1-201ENST00000616657 906 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 USP29-201ENST00000254181 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 FAM161A-202ENST00000404929 3762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AMY1B-202ENST00000370080 1787 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AC020978.8-201ENST00000571975 3022 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 CX3CR1-202ENST00000399220 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
USP17L18D6R9N7 PAQR5-201ENST00000340965 4943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms