Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BANCR-201ENST00000624238 473 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC105411.1-201ENST00000568776 1470 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL354854.1-201ENST00000455940 1363 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CLC-201ENST00000221804 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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