Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SCARNA6-201ENST00000515982 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 LRTOMT-217ENST00000539587 428 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL133297.1-201ENST00000568149 404 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC005208.1-202ENST00000587325 725 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SIGLEC31P-201ENST00000594237 551 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC004890.3-201ENST00000605566 1095 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC010333.3-201ENST00000615100 402 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC025287.2-201ENST00000621911 668 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ECHDC1-210ENST00000454859 2341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 FBXO7-202ENST00000397426 1888 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 EXD1-201ENST00000314992 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 RXFP2-201ENST00000298386 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
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DTX3Q8N9I9 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RNA5SP302-201ENST00000364896 100 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MIR431-201ENST00000385266 114 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 TP63-205ENST00000392461 1251 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL662791.3-201ENST00000413771 776 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 SMARCE1P1-201ENST00000417747 1186 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL353148.1-202ENST00000424701 551 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
DTX3Q8N9I9 NDUFB3-202ENST00000433898 503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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