Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 NIT2-201ENST00000394140 7289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 MTND6P32-201ENST00000457611 483 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PTF1AQ7RTS3 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms