Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 IGHV2-5-201ENST00000390597 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC00159-201ENST00000411605 438 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP001042.1-201ENST00000416842 487 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL049646.2-201ENST00000436848 258 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DEFA11P-201ENST00000446470 261 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GRPEL2P3-201ENST00000448626 640 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPS6P25-201ENST00000464444 748 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC026798.1-201ENST00000468490 482 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RN7SL507P-201ENST00000474076 296 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL12P8-201ENST00000482081 580 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PRSS1-204ENST00000486171 803 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC100849.1-203ENST00000518417 723 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02055-203ENST00000520068 712 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 H2AFZP4-201ENST00000534148 377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MUCL1-202ENST00000546809 439 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TUBA1C-204ENST00000549183 696 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC073176.1-201ENST00000560700 534 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01834-201ENST00000567374 385 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC006441.1-201ENST00000581083 437 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC007952.7-201ENST00000583141 757 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF585B-207ENST00000586320 403 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC060766.2-201ENST00000588235 334 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 C5orf58-206ENST00000593851 509 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 DYNLL1P3-201ENST00000596113 266 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL133351.4-201ENST00000604204 631 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC016999.2-201ENST00000614692 556 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC108724.2-201ENST00000634593 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AL355306.2-202ENST00000634380 2281 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P11-201ENST00000415278 1389 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 C2CD6-203ENST00000439802 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 AC068547.1-203ENST00000637559 1373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-AS1-201ENST00000430766 1959 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CHURC1-208ENST00000607599 3615 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 EPHA3-202ENST00000452448 2546 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 HCG18-238ENST00000449544 4262 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 SEC62-207ENST00000480708 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC6-201ENST00000277141 5724 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ANKRD39Q53RE8 RPL21-201ENST00000272274 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms