Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 OR52B5P-201ENST00000435337 951 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC115220.1-201ENST00000330020 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 PTMAP6-201ENST00000439110 327 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CTXN3Q4LDR2 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms