Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 CRYZ-203ENST00000370871 1292 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RPL26-204ENST00000578812 1002 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 CLDN12-203ENST00000394605 3488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
AP5B1Q2VPB7 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms