Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
IMPG1Q17R60 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CDY3P-201ENST00000454543 1618 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RAB5CP1-201ENST00000395972 580 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RNU7-157P-201ENST00000459600 66 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC112184.1-201ENST00000505179 312 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
IMPG1Q17R60 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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