Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SL441P-201ENST00000492388 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MYLK-221ENST00000583087 678 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AURKAPS1-201ENST00000451805 1212 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SNAP23-222ENST00000626061 237 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TAF1AQ15573 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
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