Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC020658.4-201ENST00000613987 684 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 CASP5-203ENST00000418434 1023 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
SIX1Q15475 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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SIX1Q15475 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
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SIX1Q15475 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CDH19-201ENST00000262150 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
SIX1Q15475 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
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