Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC010261.2-201ENST00000515563 588 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 TRDN-205ENST00000546248 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
RUNX3Q13761 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
RUNX3Q13761 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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