| RUNX3 | Q13761 | CHD2-202 | ENST00000420239 | 2221 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PINCR-201 | ENST00000440955 | 2228 nt | TSL 2 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NRCAM-210 | ENST00000425651 | 3915 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RCAN3-201 | ENST00000374393 | 382 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CABYR-204 | ENST00000399499 | 1272 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS4XP9-201 | ENST00000405151 | 780 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SETP9-201 | ENST00000423837 | 832 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL590723.1-201 | ENST00000426030 | 629 nt | TSL 5 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C71P-201 | ENST00000432580 | 913 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02532-206 | ENST00000433965 | 570 nt | TSL 2 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090018.1-201 | ENST00000434369 | 367 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ELOCP3-201 | ENST00000439303 | 348 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC115989.1-202 | ENST00000452153 | 1150 nt | TSL 2 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GSTM1-206 | ENST00000483399 | 512 nt | TSL 3 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIM36-IT1-201 | ENST00000503723 | 881 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010350.1-201 | ENST00000504908 | 231 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GAPDHP56-201 | ENST00000506031 | 988 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010261.2-201 | ENST00000515563 | 588 nt | TSL 2 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00589-202 | ENST00000518623 | 938 nt | TSL 4 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR8Q1P-201 | ENST00000526467 | 655 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC104241.1-201 | ENST00000530039 | 628 nt | TSL 3 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SNHG1-211 | ENST00000539921 | 1071 nt | TSL 2 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRDN-205 | ENST00000546248 | 1179 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC112693.1-201 | ENST00000555297 | 682 nt | TSL 3 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | UBE2FP2-201 | ENST00000566646 | 462 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR7853-201 | ENST00000584820 | 132 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001357.1-201 | ENST00000586304 | 1053 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CERS6-AS1-204 | ENST00000599361 | 536 nt | TSL 4 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC234771.5-201 | ENST00000600161 | 514 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AF230666.2-201 | ENST00000602328 | 725 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC073218.2-202 | ENST00000605962 | 617 nt | TSL 5 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL133406.3-201 | ENST00000606817 | 541 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP005432.2-201 | ENST00000608162 | 586 nt | BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01232-203 | ENST00000625369 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01002-236 | ENST00000634022 | 378 nt | TSL 5 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RGPD2-203 | ENST00000638730 | 5306 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR10A6-204 | ENST00000642108 | 6104 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TBC1D23-201 | ENST00000344949 | 3656 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | VPS13C-204 | ENST00000395898 | 11012 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EMSY-201 | ENST00000334736 | 5508 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NHSL2-204 | ENST00000631375 | 12593 nt | TSL 5 BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF26-201 | ENST00000328654 | 17601 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NAV3-201 | ENST00000397909 | 9821 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP1B4-201 | ENST00000218008 | 3868 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAICS-201 | ENST00000264221 | 3339 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.22 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | DECR1-215 | ENST00000522161 | 1766 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FCHSD2-208 | ENST00000458644 | 2215 nt | TSL 2 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANK2-226 | ENST00000612754 | 6134 nt | TSL 5 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAN3-202 | ENST00000399613 | 4940 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF23-207 | ENST00000564528 | 3020 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NCOA1-206 | ENST00000407230 | 4745 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.57 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR4N5-201 | ENST00000333629 | 927 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIM31-AS1-204 | ENST00000440874 | 549 nt | TSL 3 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC011753.3-201 | ENST00000443436 | 406 nt | BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPS12P31-201 | ENST00000491419 | 398 nt | BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02217-201 | ENST00000505844 | 687 nt | TSL 2 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090103.1-201 | ENST00000520386 | 485 nt | TSL 2 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC068789.1-201 | ENST00000547942 | 577 nt | TSL 2 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC090970.1-201 | ENST00000561207 | 381 nt | TSL 5 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC015727.1-201 | ENST00000572792 | 512 nt | TSL 5 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001521.2-201 | ENST00000608772 | 546 nt | BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105105.5-201 | ENST00000622635 | 1294 nt | BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC239809.3-202 | ENST00000628902 | 686 nt | TSL 5 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC00850-201 | ENST00000629221 | 685 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | EFCAB3-201 | ENST00000305286 | 1542 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MPDZ-212 | ENST00000538841 | 3186 nt | TSL 2 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | B3GNT5-201 | ENST00000326505 | 4123 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZFAND6-213 | ENST00000559835 | 1446 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MLH3-210 | ENST00000556257 | 4229 nt | TSL 5 BASIC | 5.21 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATRX-201 | ENST00000373344 | 11220 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF432-202 | ENST00000594154 | 4513 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ANO4-202 | ENST00000392979 | 3909 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PCA3-201 | ENST00000412654 | 3922 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC008691.1-207 | ENST00000636819 | 4154 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | FOXP2-204 | ENST00000390668 | 1472 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02352-202 | ENST00000559292 | 1450 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP2C1-210 | ENST00000505330 | 4888 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PAK3-213 | ENST00000620137 | 2130 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF658-201 | ENST00000612867 | 4160 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HACD3-209 | ENST00000566511 | 1782 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006210.2-201 | ENST00000367074 | 1545 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7-204 | ENST00000396467 | 1526 nt | TSL 3 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01902-203 | ENST00000637369 | 7356 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | COA1-201 | ENST00000223336 | 927 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIH1D2-201 | ENST00000280350 | 1241 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL021331.1-201 | ENST00000402817 | 582 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL6-206 | ENST00000407492 | 926 nt | TSL 3 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU2-50P-201 | ENST00000410494 | 143 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NPM1P40-201 | ENST00000412758 | 733 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PIH1D2-202 | ENST00000431456 | 1245 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092159.1-201 | ENST00000433724 | 493 nt | TSL 2 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TH2LCRR-202 | ENST00000435042 | 472 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL7P11-201 | ENST00000437586 | 658 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL713851.1-201 | ENST00000438753 | 918 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC122136.1-201 | ENST00000443971 | 478 nt | TSL 3 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000770.1-201 | ENST00000444123 | 583 nt | TSL 5 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IGHV5-78-201 | ENST00000450948 | 295 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RN7SL814P-201 | ENST00000487715 | 300 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NECTIN3-AS1-205 | ENST00000491709 | 792 nt | TSL 3 BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC105420.1-201 | ENST00000504389 | 582 nt | BASIC | 5.2 | □□□□□ -1.58 | | |