Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC008429.2-201ENST00000523057 864 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DHX8-202ENST00000540306 3809 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC010323.2-201ENST00000596405 594 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC010605.1-201ENST00000597303 797 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CYP8B1-201ENST00000316161 3974 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CHD7-202ENST00000524602 3456 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LRRC31-204ENST00000523069 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ACOD1-201ENST00000377462 2165 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 KCNA2-214ENST00000640774 6673 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CD86-201ENST00000264468 2634 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC011525.1-201ENST00000562167 5676 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GATAD2B-203ENST00000634408 1825 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PPM1L-205ENST00000498165 10934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 DLG2-201ENST00000280241 7730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 IQUB-201ENST00000324698 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CFAP47-201ENST00000297866 3608 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AIG1-209ENST00000629020 3636 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TLR4-201ENST00000355622 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 BCAT1-202ENST00000342945 4319 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SUPT7L-205ENST00000464789 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC007998.4-201ENST00000612496 2533 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 BAAT-201ENST00000259407 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SORBS1-212ENST00000371249 5927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF121-201ENST00000320451 1563 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RN7SKP36-201ENST00000363997 312 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MUC1-206ENST00000368390 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MUC1-210ENST00000368398 729 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR555-201ENST00000384987 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RPL24P2-201ENST00000421023 475 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC023274.2-201ENST00000445264 521 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 ST13P21-201ENST00000453250 1098 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 FTH1P23-201ENST00000492727 550 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 RN7SL649P-201ENST00000496974 275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC093668.1-201ENST00000514917 911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 PSD2-AS1-201ENST00000515306 412 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AC027287.2-201ENST00000547559 592 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 C14orf2-209ENST00000554880 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 AL355922.4-201ENST00000555642 449 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
CLN3Q13286 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
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