Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 RPL29P23-201ENST00000486188 442 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC113191.1-201ENST00000517759 403 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC097467.3-215ENST00000609486 793 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC097467.3-214ENST00000610249 843 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 PMS2-203ENST00000382321 1386 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 IL1R1-202ENST00000409329 1862 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC091874.2-201ENST00000505889 720 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
CASQ1P31415 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms