Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 CEP250-202ENST00000397527 15703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AL139120.1-201ENST00000443652 358 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 IGKV1OR2-9-201ENST00000603957 287 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 IGKV1OR2-11-201ENST00000604120 287 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
PTPRGP23470 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC7.89□□□□□ -1.15
PTPRGP23470 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC7.89□□□□□ -1.15
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