Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ARGFXP2-201ENST00000579304 949 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL035461.2-201ENST00000619201 524 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC02109-206ENST00000629527 854 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 IFNG-AS1-203ENST00000541715 902 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC011824.3-201ENST00000585093 563 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
SH3BP4Q9P0V3 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms