Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC00251-201ENST00000627569 1055 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LEKR1-201ENST00000356539 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PIGN-233ENST00000639342 4305 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FGFR2-218ENST00000478859 3990 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RAB5B-201ENST00000360299 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LYARP1-201ENST00000436977 1501 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CUL1-204ENST00000617797 2508 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FAM107B-203ENST00000378462 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 TYMSP1-201ENST00000407851 869 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC239367.3-201ENST00000428996 814 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FGF13-AS1-201ENST00000438238 849 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01950-202ENST00000513273 572 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RPS20-202ENST00000518875 671 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AP006587.6-201ENST00000582128 1091 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RMDN2-AS1-203ENST00000601029 613 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC092902.3-201ENST00000610060 373 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 PROX1-AS1-219ENST00000610094 791 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 LINC01876-209ENST00000638047 1983 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FXNQ16595 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms