Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL022329.1-203ENST00000453811 451 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC114954.1-201ENST00000506656 820 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FLVCR2-207ENST00000555027 938 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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SYCP1Q15431 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC013714.1-201ENST00000524707 747 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SYCP1Q15431 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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