Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC005034.3-201ENST00000604845 1747 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF484-203ENST00000395505 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TNFSF15-202ENST00000374045 6687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 OR2F1-203ENST00000641412 4829 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 C2orf71-201ENST00000331664 7044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CDH12-201ENST00000382254 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GREB1L-209ENST00000580732 8749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP001157.1-201ENST00000550837 2339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 METTL21EP-202ENST00000605100 2312 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CACNA1D-211ENST00000636570 6441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PTCH1-209ENST00000437951 8049 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF236-202ENST00000320610 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NYAP2-202ENST00000636099 5461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TACC2-202ENST00000334433 9377 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PAN2-202ENST00000425394 5372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 HEPH-209ENST00000519389 6013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DMXL2-201ENST00000251076 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 NOTCH2-201ENST00000256646 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 UNC5D-201ENST00000287272 8662 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZNF609-201ENST00000326648 8746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 KIAA1671-206ENST00000637069 6510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RYR3Q15413 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms