Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL353796.1-201ENST00000561542 3241 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MRRF-207ENST00000373729 870 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL451081.1-201ENST00000413159 245 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 INPP4B-206ENST00000506217 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
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