Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 TIAL1-203ENST00000369093 5072 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AP000688.2-201ENST00000422473 2336 ntTSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 ADH7-202ENST00000437033 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 LYSMD3-201ENST00000315948 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 MIR199B-201ENST00000384849 110 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AP001043.1-203ENST00000415824 407 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 OR7E7P-201ENST00000455678 1012 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 RN7SKP11-201ENST00000517018 287 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC068672.3-201ENST00000524017 824 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC245407.2-201ENST00000614199 451 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 ZNF519-207ENST00000590202 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 NRCAM-201ENST00000351718 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 TSC1-203ENST00000440111 8463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AL359263.1-201ENST00000441188 2796 ntBASIC7.53□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC009264.1-207ENST00000425981 1538 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 TCP11X2-202ENST00000453326 1747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 TCP11X1-201ENST00000597070 1747 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC7.52□□□□□ -1.2
NCOA4Q13772 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 RAB6C-AS1-201ENST00000412425 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 RN7SKP268-201ENST00000411107 316 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AL354983.1-201ENST00000434580 906 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AL592114.2-201ENST00000440142 532 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 AC027124.1-201ENST00000440852 466 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
NCOA4Q13772 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms