Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC8.65□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL162511.1-201ENST00000556542 879 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 ARPP21-231ENST00000474696 572 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
NEUROD1Q13562 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms