Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 COX6B1-202ENST00000392201 435 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FAM41AY1-201ENST00000421205 906 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LINC00385-201ENST00000435044 374 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 TMEM127-203ENST00000435268 582 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CFL1P8-201ENST00000436148 475 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PRSS37-203ENST00000438520 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LINC02022-201ENST00000448129 635 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 OR2AI1P-201ENST00000448534 932 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL392003.2-201ENST00000451015 679 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FAM41AY2-201ENST00000458627 906 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FAM74A1-201ENST00000465257 623 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNA5SP460-201ENST00000516789 100 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC037198.1-201ENST00000560769 281 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SNRPCP20-201ENST00000588011 210 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LINC00674-202ENST00000590734 160 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PROX1-AS1-208ENST00000601335 691 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 TSPAN6-205ENST00000614008 900 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MIR6127-201ENST00000614019 109 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CXorf57-201ENST00000372544 3607 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CNTNAP4-202ENST00000377504 4723 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 KIF13A-204ENST00000378826 5747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PLRG1-201ENST00000302078 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ZNF322-208ENST00000622479 4882 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PRICKLE1-213ENST00000639589 5761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CSRNP3-203ENST00000409420 2545 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LRTOMT-203ENST00000324866 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MFAP5-203ENST00000433590 2308 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ZNF85-202ENST00000328178 2296 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PHLDB2-207ENST00000477695 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 C15orf41-202ENST00000437989 2240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC023886.2-201ENST00000321285 411 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNA5SP145-201ENST00000363124 125 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RN7SKP93-201ENST00000363838 309 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LST1-211ENST00000376110 433 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SLC2A11-205ENST00000403208 564 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MRPL35P1-201ENST00000404272 572 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 U3.34-201ENST00000408198 212 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC022080.2-201ENST00000452932 533 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC109811.2-201ENST00000509609 452 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MTND6P20-201ENST00000522986 418 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC007751.2-201ENST00000534173 291 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 VPS13D-212ENST00000543766 3838 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RPS27AP19-201ENST00000597285 458 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL021878.2-201ENST00000602718 399 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
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MKRN4PQ13434 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AC002059.1-201ENST00000608014 477 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MAGOHB-211ENST00000625272 319 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL158175.1-201ENST00000634327 1127 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HERC2P8-202ENST00000564334 3705 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LDB2-202ENST00000441778 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 CREBRF-205ENST00000522692 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 ZNF185-204ENST00000370268 4305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 SIDT2-219ENST00000620360 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 NCAM1-228ENST00000621128 4698 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PDLIM5-222ENST00000615540 6219 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PRKAR1A-211ENST00000586397 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 LPAL2-205ENST00000639825 1536 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL033381.1-201ENST00000314040 3435 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL161636.1-201ENST00000427145 2254 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 AL022068.1-201ENST00000636202 1875 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
MKRN4PQ13434 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
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