Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 THAP12P4-201ENST00000528321 2266 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ATXN3-206ENST00000502250 1259 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 C1GALT1P3-201ENST00000522049 819 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 OR4K13-201ENST00000315693 915 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
SRSF5Q13243 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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