Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 TEX41-254ENST00000626394 423 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL049829.2-201ENST00000554010 285 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
FOXF1Q12946 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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