Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 OR52B5P-202ENST00000641118 1110 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
ACADSBP45954 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PAGE2B-202ENST00000374974 456 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TRGV7-201ENST00000427089 353 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TTC39DP-201ENST00000416781 1688 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC009884.1-201ENST00000522670 545 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 ZFP14-201ENST00000270001 7489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ACADSBP45954 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms