Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 DOCK9-203ENST00000376460 7549 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AP001596.1-202ENST00000452460 644 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 DRP2-204ENST00000538510 6852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL731532.1-201ENST00000623972 4236 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
PTPRFP10586 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms