Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

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Length 1,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RN7SKP296-201ENST00000411185 341 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 AC115223.1-201ENST00000466377 870 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC097501.1-202ENST00000514707 313 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC009852.1-201ENST00000564058 465 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AP003115.1-201ENST00000569849 463 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC100844.1-201ENST00000580622 440 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 HERC4-211ENST00000492996 3385 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 ZFP37-201ENST00000374227 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 PRKAR1A-204ENST00000536854 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 VTCN1-207ENST00000539893 2719 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC00624-201ENST00000619867 3088 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 LINC02532-207ENST00000436659 1387 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 ZNF106-201ENST00000263805 10460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 ATXN3-204ENST00000429774 6713 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
CNTN3Q9P232 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
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CNTN3Q9P232 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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CNTN3Q9P232 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PMS2P3-203ENST00000422064 567 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 BRWD1-IT1-201ENST00000435608 489 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
CNTN3Q9P232 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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