Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AL358975.1-203ENST00000413352 2932 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 C1orf194-204ENST00000369949 731 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 SLC9A9-AS2-201ENST00000490153 327 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
MIS18AQ9NYP9 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC02374-201ENST00000503637 743 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ANP32E-205ENST00000533654 908 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC105036.1-201ENST00000566222 271 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
MIS18AQ9NYP9 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
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