Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 EDNRA-204ENST00000506066 1032 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP29Q9HBJ7 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP29Q9HBJ7 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
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