Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 MRPL35P2-201ENST00000448009 511 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC078880.1-201ENST00000546696 553 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC079075.2-201ENST00000557964 449 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TM6SF1Q9BZW5 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms