Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 SLC25A3P1-203ENST00000563752 460 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DIO2-210ENST00000557010 6367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GOLGA4-202ENST00000361924 7772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC130448.2-201ENST00000624082 374 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MRPS23-201ENST00000313608 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF969P-201ENST00000510345 2341 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GAN-202ENST00000568107 15244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 USP9YP3-201ENST00000434481 1766 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 POGK-201ENST00000367875 6254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL121722.1-201ENST00000638550 4849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TRHDE-201ENST00000261180 10733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 UGT3A1-207ENST00000625798 3097 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 BRD7-202ENST00000394689 2145 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 NCAM2-202ENST00000400546 8135 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DCAF5-205ENST00000554215 4803 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL034345.2-202ENST00000416948 830 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 HTR4-206ENST00000520086 2272 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC013731.1-201ENST00000604340 883 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 PABPC1P8-201ENST00000452851 2086 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 TPR-201ENST00000367478 9708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HERC1Q15751 LINC01814-202ENST00000454224 8839 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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