Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC015726.3-201ENST00000624501 418 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
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BRD3Q15059 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 CLEC2B-202ENST00000538152 745 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
BRD3Q15059 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
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