Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC010343.3-202ENST00000510327 619 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MTND2P32-201ENST00000521584 1038 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC112693.1-201ENST00000555297 682 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF738-205ENST00000597810 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 GSTA5-201ENST00000284562 845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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ATP1A4Q13733 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
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ATP1A4Q13733 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ATP1A4Q13733 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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