Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ZCCHC10-209ENST00000513541 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC8.67□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ZCCHC6-204ENST00000375957 2262 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MTND5P12-201ENST00000502851 1449 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC073862.1-201ENST00000537998 409 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
NEUROD1Q13562 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.02
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