Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RFPL4AP6-201ENST00000616792 846 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 YWHAZP6-201ENST00000399764 738 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC079921.1-201ENST00000509449 946 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 SEC61A2-202ENST00000304267 2030 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
APOBRQ0VD83 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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