Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC096669.1-202ENST00000413708 616 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 C14orf105-202ENST00000422976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 MTCO1P49-201ENST00000523429 802 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CCDC158-201ENST00000388914 3663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TMEM209-201ENST00000397622 3545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 CLCA3P-203ENST00000490028 2781 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
LMNB1P20700 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 EEF1B2P5-201ENST00000444820 548 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC010609.1-201ENST00000519375 569 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
LMNB1P20700 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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