Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL512328.1-202ENST00000452640 850 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LAMTOR3-201ENST00000226522 1220 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPS21P4-201ENST00000487122 248 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
LRRTM2O43300 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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